Bouwend Amsterdam beschikt over een professioneel secretariaat, gehuisvest in het verenigingsgebouw aan het Muzenplein. Ambtelijk secretaris is ir. W.F.A. (Guus) Post, die fulltime beschikbaar is om de belangen voor de organisatie en de leden te behartigen. Hij wordt daarin bijgestaan door mevrouw M.H.J. (Marjan) Engers.
De dienstverlening van het secretariaat strekt zich uit over een aantal terreinen. In willekeurige volgorde gaat het hierbij onder andere om:
- het ondersteunen van de leden op individuele basis;
- het behartigen van de belangen van de leden als collectief;
- het ondersteunen van het bestuur;
- het vertegenwoordigen van de vereniging;
- het verzorgen van alle secretariaatswerkzaamheden voor de eigen organisatie;
- het verzorgen van secretariaatswerkzaamheden voor derden, zoals de Aannemers-Sociëteit Amsterdam (ASA) en de Vereniging Bouwnijverheid Noord-Holland (VBNH).
De algemeen secretaris vertegenwoordigt de organisatie, al dan niet gezamenlijk met één of meerdere bestuursleden, in tal van besturen, overlegorganen, commissies, etc..